Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP4Q9H6H4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REEP4Q9H6H4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms