Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MESP1Q9BRJ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms