Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SGIP1Q9BQI5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms