Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms