Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMKK2Q96RR4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMKK2Q96RR4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms