Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms