Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC6Q96NY7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CLIC6Q96NY7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CLIC6Q96NY7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIC6Q96NY7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIC6Q96NY7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIC6Q96NY7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIC6Q96NY7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms