Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms