Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms