Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms