Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNF8Q96H20 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNF8Q96H20 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms