Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms