Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMP4CQ96CF2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP4CQ96CF2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms