Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102AQ96A19 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms