Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKD2Q969F2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms