Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLA-CQ95604 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-CQ95604 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms