Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX1Q92499 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms