Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELQQ8TDG4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms