Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC148Q8NFR7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms