Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE23Q8NDY6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE23Q8NDY6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE23Q8NDY6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE23Q8NDY6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE23Q8NDY6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE23Q8NDY6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE23Q8NDY6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE23Q8NDY6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE23Q8NDY6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE23Q8NDY6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms