Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRBD1Q8N5C6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRBD1Q8N5C6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms