Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms