Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z401

DENND4A, C-myc promoter-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4AQ7Z401 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND4AQ7Z401 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND4AQ7Z401 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms