Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms