Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms