Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Herc4Q6PAV2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Herc4Q6PAV2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Herc4Q6PAV2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Herc4Q6PAV2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Herc4Q6PAV2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Herc4Q6PAV2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Herc4Q6PAV2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Herc4Q6PAV2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms