Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms