Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms