Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms