Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms