Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DUSP28Q4G0W2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms