Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP24-1Q3LI83 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP24-1Q3LI83 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms