Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHQ16836 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHQ16836 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHQ16836 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHQ16836 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHQ16836 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHQ16836 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHQ16836 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHQ16836 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHQ16836 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHQ16836 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHQ16836 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHQ16836 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHQ16836 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHQ16836 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHQ16836 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHQ16836 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHQ16836 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHQ16836 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHQ16836 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHQ16836 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHQ16836 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHQ16836 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHQ16836 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHQ16836 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHQ16836 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHQ16836 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHQ16836 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHQ16836 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHQ16836 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHQ16836 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHQ16836 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHQ16836 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHQ16836 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHQ16836 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHQ16836 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HADHQ16836 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHQ16836 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHQ16836 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHQ16836 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHQ16836 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHQ16836 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHQ16836 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHQ16836 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHQ16836 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHQ16836 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHQ16836 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHQ16836 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHQ16836 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHQ16836 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHQ16836 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHQ16836 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHQ16836 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHQ16836 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHQ16836 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHQ16836 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHQ16836 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHQ16836 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHQ16836 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHQ16836 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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