Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN9AQ15858 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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