Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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