Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCOLCEQ15113 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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