Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN1Q14699 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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