Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PDE6HQ13956 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6HQ13956 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PDE6HQ13956 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PDE6HQ13956 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PDE6HQ13956 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PDE6HQ13956 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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