Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1CQ13936 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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