Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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