Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN3Q13286 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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