Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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