Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 LYS9YNR050C 1341 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 SYP1YCR030C 2613 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 CCT8YJL008C 1707 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 snR80snR80 171 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 SIP2YGL208W 1248 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 GOS1YHL031C 672 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 NNF1YJR112W 606 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 RIM9YMR063W 720 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 RHO2YNL090W 579 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 SUE1YPR151C 621 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 FYV5YCL058C 459 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 CDC6YJL194W 1542 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 SOG2YOR353C 2376 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 MNS1YJR131W 1650 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 PUS1YPL212C 1635 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 RTR2YDR066C 591 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YKL153WYKL153W 510 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 BUD20YLR074C 501 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YAR064WYAR064W 300 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 TDA5YLR426W 981 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YMR221CYMR221C 1515 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 SSY5YJL156C 2100 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YEL077CYEL077C 3834 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 NRD1YNL251C 1728 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 STE5YDR103W 2754 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 THP1YOL072W 1368 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YEH2YLR020C 1617 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 FRE3YOR381W 2136 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 SUM1YDR310C 3189 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YDL009CYDL009C 324 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 ARF2YDL137W 546 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YDR431WYDR431W 312 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YIL024CYIL024C 570 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 LSM8YJR022W 330 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YLR269CYLR269C 351 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 ICY1YMR195W 384 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 IMP4YNL075W 873 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 FIT2YOR382W 462 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 SHG1YBR258C 429 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 FMP25YLR077W 1752 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 RAT1YOR048C 3021 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 ICL1YER065C 1674 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 POL12YBL035C 2118 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 SDS23YGL056C 1584 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 TDA11YHR159W 1515 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 PRP11YDL043C 801 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 SDH7YDR511W 402 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YER038W-AYER038W-A 381 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YAL004WYAL004W 648 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 LIA1YJR070C 978 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YLR031WYLR031W 561 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 FRM2YCL026C-A 582 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 WHI3YNL197C 1986 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 PPR1YLR014C 2715 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YNL095CYNL095C 1929 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 DSL1YNL258C 2265 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 HPF1YOL155C 2904 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 RPS2YGL123W 765 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YGR182CYGR182C 354 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 SOD2YHR008C 702 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YJL015CYJL015C 285 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 CDC33YOL139C 642 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 YPR077CYPR077C 372 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 VAN1YML115C 1608 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 APP1YNL094W 1764 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 GAS3YMR215W 1575 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-DR3Q12441 URC2YDR520C 2319 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 NCS2YNL119W 1482 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 VTH1YIL173W 4650 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 VTH2YJL222W 4650 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 IDP1YDL066W 1287 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YDR537CYDR537C 606 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 PMI40YER003C 1290 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 CGR1YGL029W 363 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 SUP51tL(UAA)J 84 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 EFB1YAL003W 621 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 APS3YJL024C 585 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YOR170WYOR170W 306 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 GYP6YJL044C 1377 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 RRI2YOL117W 1938 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 PAH1YMR165C 2589 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YER187WYER187W 426 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 QCR2YPR191W 1107 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 MBA1YBR185C 837 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 YPS7YDR349C 1791 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 VPS27YNR006W 1869 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 VPS1YKR001C 2115 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 SHE4YOR035C 2370 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 PRP3YDR473C 1410 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-DR3Q12441 PPQ1YPL179W 1650 nt5□□□□□ -1.61
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