Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.9□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YBR053CYBR053C 1077 nt2.9□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 TPK2YPL203W 1143 nt2.9□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 RPS23BYPR132W 438 nt2.9□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 MRP2YPR166C 348 nt2.9□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YBR089WYBR089W 600 nt2.9□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 TFC1YBR123C 1950 nt2.9□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 FLO1YAR050W 4614 nt2.9□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 NMD2YHR077C 3270 nt2.9□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 COM2YER130C 1332 nt2.9□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 VPS17YOR132W 1656 nt2.89□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 PPH3YDR075W 927 nt2.89□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 DYN2YDR424C 279 nt2.89□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 SDH3YKL141W 597 nt2.89□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 APC9YLR102C 798 nt2.89□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YLR416CYLR416C 399 nt2.89□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 PEX11YOL147C 711 nt2.89□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 TUM1YOR251C 915 nt2.89□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 SUT2YPR009W 807 nt2.89□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 ARA1YBR149W 1035 nt2.89□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 DSS1YMR287C 2910 nt2.89□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 IPI3YNL182C 1668 nt2.88□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 PIN4YBL051C 2007 nt2.88□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt2.88□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 SCM4YGR049W 564 nt2.88□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 ARC19YKL013C 516 nt2.88□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YLR012CYLR012C 300 nt2.88□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 HHF1YBR009C 312 nt2.88□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 EBS1YDR206W 2655 nt2.88□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 ATP25YMR098C 1839 nt2.88□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YNR066CYNR066C 1311 nt2.88□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YPL216WYPL216W 3309 nt2.88□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 VPS33YLR396C 2076 nt2.88□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 ECM21YBL101C 3354 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 TIF4631YGR162W 2859 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 SLI1YGR212W 1407 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 FAA2YER015W 2235 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 RRP42YDL111C 798 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YDR442WYDR442W 393 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 PPX1YHR201C 1194 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YKL091CYKL091C 933 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 RPL15AYLR029C 615 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 TEM1YML064C 738 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 RPL6AYML073C 531 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 SEC65YML105C 822 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 HHF2YNL030W 312 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 EPL1YFL024C 2499 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YIL169CYIL169C 2988 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 HEH2YDR458C 1992 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YJR061WYJR061W 2808 nt2.87□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 CCT7YJL111W 1653 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 MIX14YDR031W 366 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 RRG1YDR065W 1098 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 GRX2YDR513W 432 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YGL214WYGL214W 486 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 PRP18YGR006W 756 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YGR064WYGR064W 369 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YHR097CYHR097C 1101 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 THP2YHR167W 786 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 DAL2YIR029W 1032 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 AIM25YJR100C 984 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 SWD2YKL018W 990 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 GAB1YLR459W 1185 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YBR300CYBR300C 498 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 TLC1TLC1 1301 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YML096WYML096W 1578 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YME2YMR302C 2553 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 VIP1YLR410W 3441 nt2.86□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 SNQ2YDR011W 4506 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 XRN1YGL173C 4587 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 MRH1YDR033W 963 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 QCR10YHR001W-A 234 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YIL161WYIL161W 708 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 RNH203YLR154C 333 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 RIM9YMR063W 720 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 IZH4YOL101C 939 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 TIM12YBR091C 330 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 NDT80YHR124W 1884 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 ITT1YML068W 1395 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 VBA4YDR119W 2307 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 CIN1YOR349W 3045 nt2.85□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YAT2YER024W 2772 nt2.84□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 DYN1YKR054C 12279 nt2.84□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 BMH2YDR099W 822 nt2.84□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 SMT3YDR510W 306 nt2.84□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 RPS25AYGR027C 327 nt2.84□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 PPE1YHR075C 1203 nt2.84□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 SFH1YLR321C 1281 nt2.84□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 DUG3YNL191W 1074 nt2.84□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 BUD21YOR078W 645 nt2.84□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 MTL1YGR023W 1656 nt2.84□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 MSB2YGR014W 3921 nt2.84□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 ROG1YGL144C 2058 nt2.84□□□□□ -1.95
RRP42Q12277 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 THO1YER063W 657 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 ARI1YGL157W 1044 nt2.83□□□□□ -1.96
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