Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms