Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP4F3Q08477 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms