Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms