Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 CYR1YJL005W 6081 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 VBA4YDR119W 2307 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 GRX3YDR098C 858 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 YLR230WYLR230W 306 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 MED11YMR112C 396 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 TUM1YOR251C 915 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 MET5YJR137C 4329 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 PUF6YDR496C 1971 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 DSS1YMR287C 2910 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 IKI3YLR384C 4050 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 NSA1YGL111W 1392 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 HBT1YDL223C 3141 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 YKR015CYKR015C 1707 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 YDL162CYDL162C 357 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 IRC6YFR043C 714 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 RPL24BYGR148C 468 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 YIR014WYIR014W 729 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 VAC14YLR386W 2643 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 SEC59YMR013C 1560 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 MYO5YMR109W 3660 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 YPP1YGR198W 2454 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 YCL076WYCL076W 744 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 TGL2YDR058C 981 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 SPT15YER148W 723 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 SCL1YGL011C 759 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 RNR2YJL026W 1200 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 PBA1YLR199C 831 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 RAD10YML095C 633 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 RAS1YOR101W 930 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 RFM1YOR279C 933 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 SPS4YOR313C 1017 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM12Q04235 BCK1YJL095W 4437 nt2.59□□□□□ -2
TRM12Q04235 NAB3YPL190C 2409 nt2.59□□□□□ -2
TRM12Q04235 CHS3YBR023C 3498 nt2.59□□□□□ -2
TRM12Q04235 NDT80YHR124W 1884 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 YJL132WYJL132W 2253 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 RRP8YDR083W 1179 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 PRE1YER012W 597 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 KXD1YGL079W 657 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 AML1YGR001C 747 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 TAM41YGR046W 1158 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 FRE2YKL220C 2136 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 CYC2YOR037W 1101 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 YOR082CYOR082C 342 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 PNT1YOR266W 1272 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 MSM1YGR171C 1728 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 SRO77YBL106C 3033 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 KIN82YCR091W 2163 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 PAF1YBR279W 1338 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 DBP5YOR046C 1449 nt2.58□□□□□ -2
TRM12Q04235 BUB1YGR188C 3066 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 CTM1YHR109W 1758 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 RTT10YPL183C 3042 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 MCM21YDR318W 1107 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 YOS1YER074W-A 258 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 RPC17YJL011C 486 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 SWD2YKL018W 990 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 RCE1YMR274C 948 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 YBL094CYBL094C 333 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 YPR203WYPR203W 309 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 ESL2YKR096W 3588 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 RSN1YMR266W 2862 nt2.57□□□□□ -2
TRM12Q04235 MSH2YOL090W 2895 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 YOR365CYOR365C 2112 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 PHO81YGR233C 3537 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 NET1YJL076W 3570 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 snR70snR70 164 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 DUO1YGL061C 744 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 YJR020WYJR020W 333 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 YAL069WYAL069W 315 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 SED5YLR026C 1023 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 YLR416CYLR416C 399 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 YBL081WYBL081W 1107 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 HHF1YBR009C 312 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 PST1YDR055W 1335 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 SAP1YER047C 2694 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 TRM12YML005W 1389 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 UBP8YMR223W 1416 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 AEP2YMR282C 1743 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 SMC2YFR031C 3513 nt2.56□□□□□ -2
TRM12Q04235 EBS1YDR206W 2655 nt2.55□□□□□ -2
TRM12Q04235 MSS4YDR208W 2340 nt2.55□□□□□ -2
TRM12Q04235 MST27YGL051W 705 nt2.55□□□□□ -2
TRM12Q04235 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.55□□□□□ -2
TRM12Q04235 SPC24YMR117C 642 nt2.55□□□□□ -2
TRM12Q04235 SPP382YLR424W 2127 nt2.54□□□□□ -2
TRM12Q04235 SWC4YGR002C 1431 nt2.54□□□□□ -2
TRM12Q04235 GPP2YER062C 753 nt2.54□□□□□ -2
TRM12Q04235 CGR1YGL029W 363 nt2.54□□□□□ -2
TRM12Q04235 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.54□□□□□ -2
TRM12Q04235 PEX18YHR160C 852 nt2.54□□□□□ -2
TRM12Q04235 SYS1YJL004C 612 nt2.54□□□□□ -2
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