Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLCB3Q01970 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms