Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms